More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5166 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5166  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4485  extracellular solute-binding protein  82.18 
 
 
304 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218316  normal  0.0251052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3875  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.575894  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7239  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  54.18 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4052  extracellular solute-binding protein family 3  46.71 
 
 
289 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3522  extracellular solute-binding protein  49.82 
 
 
283 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5922  extracellular solute-binding protein family 3  44.84 
 
 
280 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.711566  normal  0.173264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2652  extracellular solute-binding protein family 3  39.64 
 
 
285 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6915  extracellular solute-binding protein family 3  44.05 
 
 
280 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5100  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 
289 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0295022  decreased coverage  0.00240656 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5623  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 
286 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.120553  normal  0.52898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1829  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.55 
 
 
288 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546299  normal  0.360728 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5840  extracellular solute-binding protein  42.13 
 
 
383 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4834  extracellular solute-binding protein family 3  42.52 
 
 
286 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951737  normal  0.158005 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6597  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5751  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6115  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 
369 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1256  extracellular solute-binding protein family 3  41.73 
 
 
285 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
268 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.74 
 
 
268 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.05 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 
268 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  37.05 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.85 
 
 
272 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
260 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.06 
 
 
282 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  32.93 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  36.43 
 
 
263 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
264 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.6 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
252 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.72 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.51 
 
 
260 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
259 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
255 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2784  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  34.48 
 
 
263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.38 
 
 
260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  34.86 
 
 
257 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 
265 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  34.86 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.9 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.03 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.04 
 
 
264 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.16 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.16 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.16 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1787  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
281 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  37.05 
 
 
264 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
250 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  37.05 
 
 
264 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 
260 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  34.13 
 
 
250 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.08 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  34.13 
 
 
250 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.65 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  32.01 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0156  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.65 
 
 
264 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3033  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.65 
 
 
264 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  30.74 
 
 
259 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1569  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.65 
 
 
264 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3338  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.65 
 
 
264 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.29 
 
 
264 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.29 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 
253 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
262 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
262 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.07 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 
250 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  30.74 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.86 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.83 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.13 
 
 
265 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>