More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5922 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5922  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.711566  normal  0.173264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6915  extracellular solute-binding protein family 3  96.43 
 
 
280 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1829  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.89 
 
 
288 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546299  normal  0.360728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4834  extracellular solute-binding protein family 3  58.75 
 
 
286 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951737  normal  0.158005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5100  extracellular solute-binding protein  57.59 
 
 
289 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0295022  decreased coverage  0.00240656 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6115  extracellular solute-binding protein  55.94 
 
 
369 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5840  extracellular solute-binding protein  55.94 
 
 
383 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6597  extracellular solute-binding protein  55.94 
 
 
286 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5751  extracellular solute-binding protein  55.94 
 
 
296 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5623  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 
286 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.120553  normal  0.52898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2652  extracellular solute-binding protein family 3  53.76 
 
 
285 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1256  extracellular solute-binding protein family 3  53.21 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3522  extracellular solute-binding protein  46.35 
 
 
283 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4485  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 
304 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218316  normal  0.0251052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5166  extracellular solute-binding protein family 3  44.84 
 
 
294 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3875  extracellular solute-binding protein family 3  42.03 
 
 
289 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.575894  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7239  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  48.43 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4052  extracellular solute-binding protein family 3  40.58 
 
 
289 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
260 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.64 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 
253 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.74 
 
 
260 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  36.26 
 
 
258 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 
268 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  39 
 
 
258 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.46 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.92 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.22 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  37.84 
 
 
258 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 
268 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.9 
 
 
254 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.66 
 
 
253 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.66 
 
 
253 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
254 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 
265 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.5 
 
 
250 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  36.2 
 
 
263 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  37.73 
 
 
263 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 
250 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 
258 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.93 
 
 
257 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  36.75 
 
 
257 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  36.43 
 
 
257 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.76 
 
 
260 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.4 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.91 
 
 
257 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
250 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
255 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.4 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.4 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.4 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.36 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.57 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.66 
 
 
260 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0335  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
245 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
250 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 
261 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  37.4 
 
 
250 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  37.4 
 
 
250 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.66 
 
 
260 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
254 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.27 
 
 
272 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2784  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 
279 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735869  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
241 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  34.84 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
261 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.35 
 
 
260 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  32.33 
 
 
259 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.29 
 
 
255 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
265 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  31.58 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 
250 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  32.27 
 
 
294 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
263 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.97 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.61 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  30.91 
 
 
257 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.09 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.74 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.21 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.64 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  33.92 
 
 
257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
260 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 
264 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  33.92 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.46 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  33.46 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.46 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>