More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4485 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4485  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218316  normal  0.0251052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5166  extracellular solute-binding protein family 3  80.86 
 
 		 294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3522  extracellular solute-binding protein  50.36 
 
 		 283 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3875  extracellular solute-binding protein family 3  48.44 
 
 		 289 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.575894  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7239  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  53.76 
 
 		 283 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4052  extracellular solute-binding protein family 3  46.71 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1829  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.85 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546299  normal  0.360728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4834  extracellular solute-binding protein family 3  45.67 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951737  normal  0.158005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2652  extracellular solute-binding protein family 3  41.2 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5840  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5623  extracellular solute-binding protein  43.7 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.120553  normal  0.52898 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5922  extracellular solute-binding protein family 3  45.45 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.711566  normal  0.173264 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6115  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 		 369 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5100  extracellular solute-binding protein  44.66 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0295022  decreased coverage  0.00240656 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5751  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 		 296 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6597  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6915  extracellular solute-binding protein family 3  45.06 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1256  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.62 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  35.84 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 260 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.5 
 
 		 282 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  36.51 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  36.27 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  34.01 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  35.04 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  35.04 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.52 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  36.51 
 
 		 241 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 241 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 263 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 265 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.03 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1449  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  32.95 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  31.43 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.14 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  36.17 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1132  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.82 
 
 		 253 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.82 
 
 		 253 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.67 
 
 		 257 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  31.64 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.68 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1787  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.1 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  34.8 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.07 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.8 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.97 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.32 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  32.82 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 248 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.49 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3033  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.4 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.4 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0156  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.4 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3338  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.4 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1569  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.4 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.57 
 
 		 262 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 261 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  32.03 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2784  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>