More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2118 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  96.59 
 
 
264 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  96.21 
 
 
264 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  96.21 
 
 
264 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  96.21 
 
 
264 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  95.83 
 
 
264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  95.83 
 
 
264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  89.02 
 
 
264 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  87.88 
 
 
264 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  88.26 
 
 
264 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  75.38 
 
 
264 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  74.62 
 
 
264 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  75.09 
 
 
265 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  62.2 
 
 
262 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  63.37 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  61.38 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  61.38 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  60.08 
 
 
259 aa  301  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0110  extracellular solute-binding protein  63.48 
 
 
281 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  62.34 
 
 
264 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0120  extracellular solute-binding protein  63.48 
 
 
262 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3432  extracellular solute-binding protein  58.4 
 
 
259 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2491  extracellular solute-binding protein family 3  61.23 
 
 
258 aa  294  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  61.84 
 
 
264 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.72 
 
 
264 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  62.72 
 
 
264 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.28 
 
 
273 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1449  extracellular solute-binding protein family 3  61.23 
 
 
258 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  56.52 
 
 
257 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3033  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.28 
 
 
264 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0156  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.28 
 
 
264 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1569  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.28 
 
 
264 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3338  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  62.28 
 
 
264 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.86 
 
 
260 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.69 
 
 
260 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.08 
 
 
262 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  54.69 
 
 
260 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.69 
 
 
260 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.86 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  60.62 
 
 
263 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.86 
 
 
260 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  55.08 
 
 
262 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.08 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.08 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.08 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  55.08 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.82 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  55.08 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  55.08 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  53.91 
 
 
260 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  54.23 
 
 
262 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  55 
 
 
260 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.14 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  55.65 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0032  extracellular solute-binding protein family 3  60.18 
 
 
262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4434  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.4 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  54.3 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.3 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.3 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.66 
 
 
257 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  57.14 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.69 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.84 
 
 
257 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.12 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.12 
 
 
260 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0821  extracellular solute-binding protein  57.56 
 
 
259 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206084  normal  0.0792038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  57.56 
 
 
259 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  57.56 
 
 
259 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2538  extracellular solute-binding protein  58.87 
 
 
259 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527572  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3939  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.14 
 
 
259 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  hitchhiker  0.00393875 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  54.25 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.33 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.33 
 
 
260 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2469  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  55.65 
 
 
256 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  53.33 
 
 
260 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.33 
 
 
260 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0724  extracellular solute-binding protein  55.88 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  50.6 
 
 
258 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0741  extracellular solute-binding protein  55.88 
 
 
259 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.17 
 
 
259 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2568  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.85 
 
 
259 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2449  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.92 
 
 
258 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2790  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.09 
 
 
259 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239509  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  56.19 
 
 
260 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5731  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.08 
 
 
260 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  55.95 
 
 
260 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  55.95 
 
 
260 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51 
 
 
257 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  51.98 
 
 
261 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.7 
 
 
260 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>