More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6915 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6915  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5922  extracellular solute-binding protein family 3  96.43 
 
 
280 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.711566  normal  0.173264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1829  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.25 
 
 
288 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546299  normal  0.360728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4834  extracellular solute-binding protein family 3  58.37 
 
 
286 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951737  normal  0.158005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5100  extracellular solute-binding protein  57.2 
 
 
289 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0295022  decreased coverage  0.00240656 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6115  extracellular solute-binding protein  55.17 
 
 
369 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5751  extracellular solute-binding protein  55.17 
 
 
296 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6597  extracellular solute-binding protein  55.17 
 
 
286 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5840  extracellular solute-binding protein  55.17 
 
 
383 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5623  extracellular solute-binding protein  54.79 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.120553  normal  0.52898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2652  extracellular solute-binding protein family 3  52.63 
 
 
285 aa  275  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1256  extracellular solute-binding protein family 3  52.08 
 
 
285 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3522  extracellular solute-binding protein  45.62 
 
 
283 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4485  extracellular solute-binding protein  43.98 
 
 
304 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218316  normal  0.0251052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5166  extracellular solute-binding protein family 3  44.05 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7239  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  48.03 
 
 
283 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3875  extracellular solute-binding protein family 3  41.42 
 
 
289 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.575894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4052  extracellular solute-binding protein family 3  40.3 
 
 
289 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
253 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 
260 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  38.46 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  37.98 
 
 
261 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.96 
 
 
260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  35.9 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  38.81 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.84 
 
 
256 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.02 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.02 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
268 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  37.07 
 
 
258 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
282 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.9 
 
 
254 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.74 
 
 
268 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  36.74 
 
 
268 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 
258 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 
254 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
257 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 
253 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  37 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.93 
 
 
257 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 
263 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.59 
 
 
250 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.4 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 
265 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 
261 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 
250 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.4 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.4 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.4 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.56 
 
 
260 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
255 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  36.99 
 
 
250 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  36.99 
 
 
250 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
250 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  31.64 
 
 
259 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2784  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 
279 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  35.79 
 
 
257 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
250 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.82 
 
 
260 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
254 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
265 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 
257 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.82 
 
 
260 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.45 
 
 
257 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
248 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0335  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.47 
 
 
272 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  32.67 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
241 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  34.43 
 
 
241 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  34.43 
 
 
241 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  31.95 
 
 
259 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
250 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 
260 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  32.95 
 
 
260 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
248 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  31.2 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2495  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 
260 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.89405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2595  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 
260 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473996  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2583  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 
260 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2541  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 
260 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2704  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  34.39 
 
 
260 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.75 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.58 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  30.18 
 
 
257 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.88 
 
 
257 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 
268 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>