More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3473 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3473  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.71315  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3742  ABC amino acid transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5809  extracellular solute-binding protein  62.45 
 
 
269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.287013  normal  0.321236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.1 
 
 
264 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.1 
 
 
264 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 
261 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  32.02 
 
 
264 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.02 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  35.56 
 
 
266 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
315 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.75 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 
264 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 
266 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
264 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
264 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
264 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  31.8 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.27 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.09 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.38 
 
 
264 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.81 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.64 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.3 
 
 
266 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.41 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.81 
 
 
285 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.81 
 
 
266 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  33.07 
 
 
265 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
270 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
266 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.2 
 
 
266 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.41 
 
 
266 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
266 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.41 
 
 
285 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
270 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.2 
 
 
266 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.41 
 
 
266 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
266 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
266 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.91 
 
 
260 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  32.91 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.4 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.4 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.12 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  32.91 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.4 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  32.42 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  32.91 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.42 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.42 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
483 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  32.88 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.73 
 
 
268 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>