19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4246 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  96.56 
 
 		 266 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  92.86 
 
 		 266 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  84.52 
 
 		 252 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  69.13 
 
 		 277 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  62.24 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  64.57 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  57.25 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  46.03 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  38.91 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  35.34 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  35.34 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.92 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  36.1 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  36.84 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  36.4 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>