23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2471 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  99.64 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  97.15 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  96.09 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  64.55 
 
 		 268 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  62.72 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  52 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  39.82 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  36.4 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  36.84 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  36.04 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  32.66 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.28 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14271  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0614  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2232  hypothetical protein  24.39 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.29 
 
 		 912 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>