19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1833 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  81.72 
 
 		 279 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  61.02 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  58.87 
 
 		 252 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  57.25 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  56.86 
 
 		 266 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  60.7 
 
 		 266 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  47.37 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  36.26 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  37.56 
 
 		 268 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  32.39 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  34.73 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.17 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  32.66 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  32.66 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  34.21 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  35.06 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  28.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>