20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3812 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  92.86 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  93.13 
 
 		 266 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  85.26 
 
 		 252 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  67.39 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  62.88 
 
 		 263 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  63.88 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  56.69 
 
 		 279 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  45.49 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  38.13 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  35.37 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  35.34 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  36 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  35.24 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  35.24 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  35.24 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  34.8 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  28.47 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  25.78 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>