20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2113 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  52.97 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  50.19 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  52 
 
 		 281 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  52 
 
 		 276 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  52 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  51.11 
 
 		 276 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  36.4 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  37.77 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  37.39 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  32.39 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  22.67 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>