272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2774 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2774  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  43.06 
 
 		 576 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  43.14 
 
 		 565 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1279 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1322 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3153  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.11 
 
 		 842 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.256561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 843 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 682 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.55 
 
 		 853 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1594  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.68 
 
 		 842 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 767 aa  98.2  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.57 
 
 		 860 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.98 
 
 		 761 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1265  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.22 
 
 		 758 aa  91.7  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  29.21 
 
 		 597 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  29.21 
 
 		 599 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  31.11 
 
 		 596 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0931  solute-binding family 3 protein  25.32 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000314501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  24.35 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1064  EAL domain-containing protein  22.42 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0102515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 1055 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 604 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 		 830 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.42 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  32.87 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1237  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000616234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  31.33 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 584 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  25.99 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  29.55 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 1165 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  27 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  28.44 
 
 		 596 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  30 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2229  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.26 
 
 		 981 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0465115  normal  0.264216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 590 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0403  putative PAS/PAC sensor protein  23.93 
 
 		 456 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.21 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  32.65 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 306 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  25.73 
 
 		 286 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 378 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.5 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 665 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  29.01 
 
 		 935 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  26.51 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 		 770 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  31.31 
 
 		 608 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 584 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.38 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.91 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  24.32 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  26.9 
 
 		 572 aa  52  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 620 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  26.76 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  26.76 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 1093 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.3 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  25.49 
 
 		 727 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 609 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  24.88 
 
 		 560 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  25 
 
 		 578 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  30.32 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.53 
 
 		 2035 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  26.02 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  25.33 
 
 		 736 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  26.76 
 
 		 572 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 710 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  29.17 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  31.52 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  29.17 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  27.54 
 
 		 468 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 1090 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0217  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  28.87 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  24.44 
 
 		 578 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  26.97 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>