187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2431 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 693 aa  1380    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 		 644 aa  630  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  49.72 
 
 		 679 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  51.72 
 
 		 650 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  50.7 
 
 		 690 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  50.62 
 
 		 663 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.19 
 
 		 692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  51.7 
 
 		 681 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  51.49 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 		 701 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  50.7 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  50.91 
 
 		 693 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  52.66 
 
 		 653 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  61.47 
 
 		 690 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  43.72 
 
 		 701 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 647 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 		 657 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  34.55 
 
 		 667 aa  321  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  34.92 
 
 		 690 aa  320  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  39.19 
 
 		 599 aa  295  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  37.8 
 
 		 619 aa  290  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  34.69 
 
 		 658 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  37.05 
 
 		 601 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  39.87 
 
 		 646 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 612 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.09 
 
 		 607 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 522 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.83 
 
 		 579 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 587 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.53 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 517 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  29.15 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  29.22 
 
 		 503 aa  181  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 		 572 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 680 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 612 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30.07 
 
 		 572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  31.46 
 
 		 572 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.48 
 
 		 576 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  29.91 
 
 		 578 aa  168  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32 
 
 		 577 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 		 586 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 588 aa  157  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  31.7 
 
 		 585 aa  157  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  28.11 
 
 		 531 aa  157  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 572 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  33.44 
 
 		 310 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.94 
 
 		 573 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 		 573 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 573 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.82 
 
 		 595 aa  120  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.88 
 
 		 564 aa  120  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.22 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  36.11 
 
 		 304 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 		 611 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.1 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 		 344 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  30.55 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.69 
 
 		 337 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  32.66 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  25.79 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 220 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.24 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 316 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  31.09 
 
 		 293 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 334 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  62  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  26.24 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.65 
 
 		 319 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.05 
 
 		 351 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>