175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  28 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  47.54 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  40.82 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  39.66 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  44 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>