232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0153 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  100 
 
 		 488 aa  962    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  41.39 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.49 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.6 
 
 		 388 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  40.55 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.4 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.07 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.4 
 
 		 455 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  36.44 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.05 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.67 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.11 
 
 		 403 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.42 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  36.93 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.18 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.9 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.94 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.12 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.39 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.48 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  31.55 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  33.62 
 
 		 482 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  31.56 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.38 
 
 		 841 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  31.79 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.27 
 
 		 2172 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  30.39 
 
 		 676 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  30.79 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.1 
 
 		 809 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  34.04 
 
 		 712 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  31.94 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.09 
 
 		 875 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  29.28 
 
 		 766 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.33 
 
 		 1657 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  33.73 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  32.41 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 892 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  52.53 
 
 		 1631 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.45 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 		 374 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  31.05 
 
 		 388 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  38.04 
 
 		 1421 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  33.19 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  31.7 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  30.65 
 
 		 518 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  31.48 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  31.15 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  49.51 
 
 		 1389 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  29.47 
 
 		 972 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  32.09 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.17 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  31.76 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  29.32 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  29.06 
 
 		 1132 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  27.98 
 
 		 999 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  29.49 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  27.98 
 
 		 999 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.4 
 
 		 999 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  36.81 
 
 		 1202 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  30.62 
 
 		 1029 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  26.58 
 
 		 908 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  26.72 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.67 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  34.42 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.82 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.84 
 
 		 941 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  31.21 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 		 369 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.25 
 
 		 1200 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  30.94 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  26.1 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  25.47 
 
 		 918 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  26.57 
 
 		 1151 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  27.97 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.67 
 
 		 729 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  26.16 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.15 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  24.48 
 
 		 1182 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  36.04 
 
 		 4723 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  29.28 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  29.31 
 
 		 909 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  24.76 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>