173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2392 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  100 
 
 		 2402 aa  4683    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.43 
 
 		 3544 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.87 
 
 		 4231 aa  327  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.55 
 
 		 3244 aa  318  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  28.45 
 
 		 2079 aa  317  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.07 
 
 		 3699 aa  316  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.42 
 
 		 3699 aa  313  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.3 
 
 		 11716 aa  309  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  27.53 
 
 		 1779 aa  281  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.8 
 
 		 4465 aa  246  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.06 
 
 		 3563 aa  230  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  30.19 
 
 		 2820 aa  222  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  29.56 
 
 		 2853 aa  219  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  28.04 
 
 		 2344 aa  203  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  28.74 
 
 		 3562 aa  196  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  51.98 
 
 		 2271 aa  162  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  51.98 
 
 		 2271 aa  162  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.01 
 
 		 3542 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  27.03 
 
 		 2704 aa  159  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.97 
 
 		 3598 aa  156  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  26.08 
 
 		 1672 aa  149  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 		 2588 aa  140  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  32.54 
 
 		 683 aa  140  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1879 aa  137  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  24.89 
 
 		 3824 aa  134  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  25.17 
 
 		 3824 aa  132  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.41 
 
 		 6683 aa  132  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  50.28 
 
 		 1870 aa  131  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  24.56 
 
 		 3739 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 6779 aa  127  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  24.99 
 
 		 3824 aa  127  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  26.19 
 
 		 6662 aa  126  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.96 
 
 		 3552 aa  126  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.54 
 
 		 2522 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.49 
 
 		 1673 aa  117  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  24.06 
 
 		 3721 aa  115  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  28.65 
 
 		 2636 aa  107  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  24.36 
 
 		 8064 aa  104  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  32.68 
 
 		 2001 aa  103  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.24 
 
 		 887 aa  101  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  28.54 
 
 		 5451 aa  99.8  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  24.45 
 
 		 4106 aa  96.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1282 aa  94  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  26.42 
 
 		 1232 aa  92.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  24.08 
 
 		 6310 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  26.71 
 
 		 962 aa  91.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  27.78 
 
 		 1222 aa  91.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  33.97 
 
 		 1148 aa  91.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.79 
 
 		 2272 aa  87.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25.42 
 
 		 1141 aa  86.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  34.52 
 
 		 494 aa  85.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  26.5 
 
 		 3089 aa  84.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  30.03 
 
 		 3923 aa  82  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  26.12 
 
 		 5561 aa  78.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  26.16 
 
 		 5559 aa  77  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  26.3 
 
 		 5559 aa  76.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  33.14 
 
 		 2506 aa  76.3  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  28.85 
 
 		 3911 aa  75.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  33.49 
 
 		 4672 aa  75.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  26.21 
 
 		 1544 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  26.33 
 
 		 5561 aa  75.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  27.9 
 
 		 3477 aa  73.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  27.84 
 
 		 2064 aa  73.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  35.47 
 
 		 672 aa  72.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  30.69 
 
 		 539 aa  72.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  32.83 
 
 		 731 aa  71.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  32.61 
 
 		 500 aa  70.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.6 
 
 		 5899 aa  69.7  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.5 
 
 		 978 aa  69.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  23.74 
 
 		 1094 aa  68.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.47 
 
 		 2701 aa  68.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  32.1 
 
 		 926 aa  67  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  23.43 
 
 		 2193 aa  66.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 1728 aa  66.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  26.52 
 
 		 5561 aa  65.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  24.3 
 
 		 1081 aa  65.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.54 
 
 		 2839 aa  65.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  34.81 
 
 		 2132 aa  65.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  27.95 
 
 		 5171 aa  65.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 898 aa  65.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1682 aa  64.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  33.51 
 
 		 4430 aa  64.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.9 
 
 		 2625 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.94 
 
 		 2713 aa  63.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  26.29 
 
 		 2397 aa  63.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.13 
 
 		 752 aa  63.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  29.8 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  32.19 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1457 aa  62.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  57.45 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  57.45 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 		 1092 aa  62  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  33.18 
 
 		 884 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.64 
 
 		 2833 aa  61.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.22 
 
 		 815 aa  61.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.88 
 
 		 1332 aa  60.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  38.79 
 
 		 1153 aa  60.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  38.79 
 
 		 1153 aa  60.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  32.67 
 
 		 753 aa  60.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.33 
 
 		 1394 aa  60.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>