More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3603 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 
173 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  53.99 
 
 
171 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2994  sigma-24 (FecI-like)  40.27 
 
 
183 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  41.28 
 
 
173 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  41.1 
 
 
175 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2918  putative extracytoplasmic function sigma factor (IRON-regulated) transcription regulator protein  43.05 
 
 
174 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  41.1 
 
 
175 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0655  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  42.54 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  36.08 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  40.54 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4054  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.71 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4736  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.91 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1645  RNA polymerase sigma factor  38.36 
 
 
158 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3759  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  38.71 
 
 
180 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2428  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.73 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0553683  normal  0.487095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4015  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.04 
 
 
166 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2873  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.86 
 
 
210 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.444727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.29 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4479  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.41 
 
 
171 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1353  sigma-24 (FecI-like)  35.19 
 
 
171 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.9 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2728  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.99 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2648  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.84 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4208  RNA polymerase sigma factor  39.86 
 
 
158 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3128  sigma-24 (FecI-like)  35.71 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  37.91 
 
 
440 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6117  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  38.16 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2212  sigma-24 (FecI-like)  34.38 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3780  RNA polymerase sigma factor  38.22 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.68 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1120  FecI-like sigma-24  38.12 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33800  RNA polymerase sigma factor  42.67 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000282652  hitchhiker  0.00445082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.19 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25390  RNA polymerase sigma factor, FecI family  36.6 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1839  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  39.71 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0342847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1442  sigma-24 (FecI-like)  31.47 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558792  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3752  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.54 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3282  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.65 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1076  sigma-24 (FecI-like)  33.12 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525306  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3532  RNA polymerase sigma factor  36.3 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.997042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25660  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.7 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1340  fec I like protein  38.06 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  33.56 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.23 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5953  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.93 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.23 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  40.26 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2051  fec I like protein  38.89 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.62 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2205  sigma-24 (FecI-like)  40.46 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  35.57 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40.26 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.6 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3959  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  35.34 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  33.81 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4499  RNA polymerase sigma J factor  34.51 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00864259  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.21 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  34.25 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  34.12 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1969  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.64 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.23 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0480  sigma-24 (FecI-like)  31.21 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637094  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5187  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.72 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572123  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6284  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.72 
 
 
227 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3476  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.69 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1861  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.08 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.24154  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00872  extracytoplasmic function sigma factor transcription regulator protein  34.42 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037032  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0883  sigma-24 (FecI)  37.86 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2397  sigma-24 (FecI)  34.03 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.103635  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4119  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.69 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4275  sigma24, FecI  36.69 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2381  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.04 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.599454  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2143  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.69 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1832  sigma-70 region 2  32.64 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931587  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.75 
 
 
374 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  34.15 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.75 
 
 
374 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  35.37 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2232  sigma-24 (FecI-like)  34.84 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684813  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2387  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.19 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  0.608857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55550  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  33.97 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0813524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4244  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  37.06 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2779  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.87 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310958  normal  0.121216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.55 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1206  RNA polymerase sigma factor  31.69 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6508  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.06 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  0.188275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  33.56 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17710  sigma factor, FecI family  30.49 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  31.25 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0690  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.07 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4835  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  32.03 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.76 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2124  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334185  normal  0.110092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3086  RNA polymerase sigma-70 factor, putative  32.17 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2781  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.92 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7286  sigma factor  32.9 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4594  RNA polymerase sigma factor  30.38 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.05 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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