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for query gene PSPA7_1717 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  100 
 
 
171 aa  337  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  96.49 
 
 
171 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  49.69 
 
 
163 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4533  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.72 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.76 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.41 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  40.25 
 
 
188 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.1 
 
 
171 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.27 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  36.55 
 
 
151 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3079  fec I like protein  34.78 
 
 
170 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  39.61 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  38.67 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1052  sigma-24 (FecI-like)  38.75 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.719626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3045  fec I like protein  35.58 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.688858  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2372  sigma-24 (FecI)  36.59 
 
 
214 aa  94.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0392872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  38.36 
 
 
181 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  39.87 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1734  FecI like protein  39.62 
 
 
236 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.112021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1832  sigma-70 region 2  31.17 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931587  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2051  fec I like protein  37.5 
 
 
176 aa  90.5  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2387  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.18 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  0.608857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2397  sigma-24 (FecI)  35.33 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.103635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  40.46 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1978  sigma-24 (FecI-like)  32.3 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.912668  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25390  RNA polymerase sigma factor, FecI family  34.19 
 
 
234 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4981  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.14 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000475224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4054  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.55 
 
 
180 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.42 
 
 
167 aa  89  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3759  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  35 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45020  RNA polymerase sigma factor, ECF subfamily  38.27 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1423  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0182101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  36.84 
 
 
168 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2883  fec I like protein  36.5 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4313  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.08 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  0.0110749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4015  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.52 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40.15 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.97 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  39.16 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.73 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.34 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.34 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.34 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33800  RNA polymerase sigma factor  39.86 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000282652  hitchhiker  0.00445082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3733  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.01 
 
 
207 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0688  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.92 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.959596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1120  FecI-like sigma-24  36.25 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.58 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.54 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  31.74 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0894  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.59 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  40.91 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  34.69 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.19 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.9 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0865  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.08 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622636  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.81 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.74 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.04 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0895  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.08 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.248298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6157  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.18 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  34.39 
 
 
196 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2994  sigma-24 (FecI-like)  34.59 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4099  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.81 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5893  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.34 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.830728  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3786  sigma-24 (FecI)  35.1 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  34.15 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.15 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3959  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  32.59 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  36.13 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  31.45 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.36 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4366  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.64 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.64 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  32.26 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4159  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.64 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2429  transcriptional regulator, LuxR family  34.73 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2143  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.78 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  34.84 
 
 
374 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1969  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.71 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3282  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.41 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1839  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.52 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0342847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0745  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.72 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2388  sigma-24 (FecI-like)  26.38 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0412661  hitchhiker  0.0000504088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4479  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.19 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3476  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.24 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  31.76 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0872  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.98 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5953  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.55 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4750  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.76 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135059  normal  0.660799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.88 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.685716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4761  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.29 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2428  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.3 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0553683  normal  0.487095 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5129  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.22 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0324934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1645  RNA polymerase sigma factor  34.67 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_3532  RNA polymerase sigma factor  34.48 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.997042 
 
 
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NC_012560  Avin_40940  RNA polymerase sigma factor, FecI family  31.48 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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