More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  67.18 
 
 
195 aa  239  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  68.89 
 
 
181 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  66.47 
 
 
188 aa  222  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  57.14 
 
 
191 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  57.14 
 
 
194 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  59.12 
 
 
191 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  62.05 
 
 
165 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4119  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  48.32 
 
 
165 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4275  sigma24, FecI  48.32 
 
 
165 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.76 
 
 
175 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.12 
 
 
171 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  37.76 
 
 
173 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2529  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.99 
 
 
202 aa  92  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  35.71 
 
 
166 aa  89  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.18 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  38.59 
 
 
171 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.97 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21550  ECF sigma factor, FecI family  36.57 
 
 
175 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.86 
 
 
165 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2918  putative extracytoplasmic function sigma factor (IRON-regulated) transcription regulator protein  36.3 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.36 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  33.33 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  37.23 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40940  RNA polymerase sigma factor, FecI family  33.54 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.36 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4313  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.12 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737925  normal  0.0110749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0688  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.18 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.959596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0865  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.22 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622636  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0895  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.26 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.248298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4780  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.93 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.71 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2075  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.4 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2598  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  39.13 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4391  sigma-24 (FecI-like)  34.42 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.934112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  36.36 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6284  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.97 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3706  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.33 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  36.81 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0606  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.52 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  29.07 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1623  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.45 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710991  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.62 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25290  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  37.41 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3810  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.45 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.775772  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1839  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.33 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0342847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3563  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.45 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3941  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.58 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.664668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  36.81 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2633  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.26 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.75 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1442  sigma-24 (FecI-like)  31.34 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558792  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33260  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.7 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268823  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3324  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.14 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40230  RNA polymerase sigma factor, FecI family  33.54 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2388  sigma-24 (FecI-like)  29.76 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0412661  hitchhiker  0.0000504088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2133  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.72 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0872  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.21 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4208  RNA polymerase sigma factor  33.8 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506383  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1218  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.25 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  31.9 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2949  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.35 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1943  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  32.7 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467339  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2883  fec I like protein  38.13 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3786  sigma-24 (FecI)  35.14 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4981  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.89 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000475224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2827  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  30.19 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2648  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40.32 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0745  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.25 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.84 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0048  transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.426983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  29.52 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1659  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.82 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.65 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3045  fec I like protein  33.33 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.688858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  34.51 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1645  RNA polymerase sigma factor  34.51 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.87 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0578  RNA polymerase sigma factor  34.01 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3563  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.25 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235301  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.78 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.746772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1495  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.75 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.420653  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0951  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.92 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.941158  normal  0.954881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02747  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  30.72 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5953  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.42 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1206  RNA polymerase sigma factor  34.07 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06180  RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281942  normal  0.0383866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4244  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  30.82 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3274  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.86 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41453  normal  0.0460186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.82 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3282  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.04 
 
 
194 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2873  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.74 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.444727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.71 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_4366  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.71 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3812  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.95 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0938836  normal  0.91348 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  33.1 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
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