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for query gene PputGB1_1521 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 
163 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  49.69 
 
 
171 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  48.43 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  43.04 
 
 
188 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.36 
 
 
165 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.94 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.94 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.73 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  38.85 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3045  fec I like protein  35.06 
 
 
182 aa  84  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.688858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.5 
 
 
194 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.5 
 
 
191 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.91 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  36.18 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2387  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.54 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  0.608857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3835  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.58 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.48 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4054  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.31 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3759  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  36.31 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  34.64 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4533  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.82 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  36.08 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2529  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.15 
 
 
202 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5453  sigma-24 (FecI-like)  34.19 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40.15 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5953  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.42 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0688  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.45 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.959596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1052  sigma-24 (FecI-like)  33.77 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.719626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1522  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.09 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  39.29 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2429  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4403  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.48 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1734  FecI like protein  40 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.112021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0872  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.13 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1861  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.53 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.24154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  34.87 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  33.74 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4731  RNA polymerase sigma factor  36.18 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2598  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.12 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.69 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.69 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2994  sigma-24 (FecI-like)  35.03 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.72 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.69 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  33.77 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.42 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2728  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.61 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1839  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  33.56 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0342847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0745  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.5 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4015  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.24 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.92 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3959  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  29.75 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0444  RNA polymerase sigma-70 family protein  32.89 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.81 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0883  sigma-24 (FecI)  36.36 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2388  sigma-24 (FecI-like)  29.93 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0412661  hitchhiker  0.0000504088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3086  RNA polymerase sigma-70 factor, putative  32.24 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3271  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.73 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.24577  normal  0.0205939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  32.47 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1828  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.99 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  0.28254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  34.93 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  36.42 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6662  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.93 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.12 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.685716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3532  RNA polymerase sigma factor  32.56 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.997042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2779  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.24 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.310958  normal  0.121216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4391  sigma-24 (FecI-like)  33.11 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.934112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6742  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.52 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318471  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04159  RNA polymerase, sigma 19 factor  32.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3707  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0745  RNA polymerase sigma factor FecI  32.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  normal  0.166474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4870  RNA polymerase sigma factor FecI  32.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  39.07 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  37.09 
 
 
374 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04122  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0923  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.81 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.76 
 
 
374 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3780  RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.93 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0925  RNA polymerase sigma factor  29.41 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  33.33 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06180  RNA polymerase sigma factor  37.01 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281942  normal  0.0383866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3510  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.11 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40940  RNA polymerase sigma factor, FecI family  33.12 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55550  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  35.04 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0813524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.1 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25290  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  34.48 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  29.08 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3315  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.88 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1832  sigma-70 region 2  29.22 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931587  normal  0.10275 
 
 
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NC_011071  Smal_2143  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.43 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1076  sigma-24 (FecI-like)  30.46 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525306  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  35.1 
 
 
374 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4594  RNA polymerase sigma factor  34.39 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.97 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_0378  RNA polymerase sigma factor  34.9 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425912  normal 
 
 
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NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  32.33 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
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