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for query gene Pecwa_1816 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  88.17 
 
 
169 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40 
 
 
171 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  39.41 
 
 
171 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.94 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4533  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  35.57 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.89 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6088  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.29 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  36.42 
 
 
188 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  37.96 
 
 
151 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.42 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4054  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.55 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3759  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  33.55 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.26 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2124  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.64 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334185  normal  0.110092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2372  sigma-24 (FecI)  34.84 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0392872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.33 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.33 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  30.77 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.33 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3045  fec I like protein  33.97 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.688858  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  36.73 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.13 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  36.05 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2428  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.29 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0553683  normal  0.487095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  35.26 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.13 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  36 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3282  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.09 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.81 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.26 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.62 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1832  sigma-70 region 2  30.63 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931587  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1500  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.46 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  34.13 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4015  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.58 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.346038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.68 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.685716 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5953  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.94 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0894  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.25 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2429  transcriptional regulator, LuxR family  32.9 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2397  sigma-24 (FecI)  31.76 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.103635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 
374 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1969  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.77 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1861  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.89 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.24154  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2728  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.52 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3733  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.73 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.12 
 
 
374 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  37.31 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1978  sigma-24 (FecI-like)  31.61 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.912668  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3835  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.83 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4791  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.25 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0414375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4391  sigma-24 (FecI-like)  34.16 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.934112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.85 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  34.9 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0655  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.86 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  32.75 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2883  fec I like protein  32.59 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  32.48 
 
 
374 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2387  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.87 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  0.608857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2829  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.13 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0704  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.95 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.91 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0883  sigma-24 (FecI)  31.65 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  33.96 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  32.5 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  34.23 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  34.04 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2143  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.38 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1442  sigma-24 (FecI-like)  33.77 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558792  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2648  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.62 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0738  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.76 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1052  sigma-24 (FecI-like)  32.91 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.719626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  29.88 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5187  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.29 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572123  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2338  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.81 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  33.13 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2388  sigma-24 (FecI-like)  28.48 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0412661  hitchhiker  0.0000504088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  27.16 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1206  RNA polymerase sigma factor  32.26 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4750  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.91 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135059  normal  0.660799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3079  fec I like protein  27.94 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  29.45 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 
440 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0304  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.18 
 
 
208 aa  64.3  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3476  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.87 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0737  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.76 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2633  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.34 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1076  sigma-24 (FecI-like)  31.61 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525306  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2994  sigma-24 (FecI-like)  31.37 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.29 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2381  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.599454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4736  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.25 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3563  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.25 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0235301  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1828  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  0.28254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 
444 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2212  sigma-24 (FecI-like)  30.67 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4594  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_4761  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.98 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_4021  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  30.38 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27293  n/a   
 
 
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