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for query gene Pput_4467 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4467  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  100 
 
 
194 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4608  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  97.91 
 
 
191 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4590  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  90.58 
 
 
191 aa  350  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0856  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  90.91 
 
 
165 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0929  sigma-24 (FecI)  72.07 
 
 
188 aa  251  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.309096  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0227  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  63.33 
 
 
195 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01840  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  64.53 
 
 
181 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.729146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10480  ECF sigma factor, FecI family  59.32 
 
 
194 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.609538  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4275  sigma24, FecI  45.52 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4119  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  45.52 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.62 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.62 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4377  sigma-24 (FecI)  34.16 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4216  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.29 
 
 
170 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1008  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  34.71 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.719302  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2303  fec I like protein  33.99 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1045  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.71 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1007  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.71 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1521  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.5 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2265  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.1 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4391  sigma-24 (FecI-like)  35.71 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.934112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6284  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.27 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4780  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.06 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  33.33 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2648  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.89 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1717  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  38.62 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2633  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.94 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1107  sigma-70 region 2  35.54 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  32.03 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.42 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2774  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.13 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2918  putative extracytoplasmic function sigma factor (IRON-regulated) transcription regulator protein  34.46 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4508  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.77 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.39 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1816  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.26 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  31.37 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1442  sigma-24 (FecI-like)  26.32 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.558792  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0699  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.84 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.390031  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1286  RNA polymerase sigma-70 family protein  35.54 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4299  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.38 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3701  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.24 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.266091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.188745  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19990  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  36.55 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223745  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39800  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  31.79 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4981  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.38 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000475224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2827  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  29.89 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3316  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.55 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3796  sigma-24 (FecI)  32.68 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40940  RNA polymerase sigma factor, FecI family  31.37 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33260  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  29.31 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268823  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4231  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.28 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0176  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.43 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658272  normal  0.578435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4091  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  35.37 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25660  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  31.17 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4366  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.28 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4159  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.28 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7286  sigma factor  27.44 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7229  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.69 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0048  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.426983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1218  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.23 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3271  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.68 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.24577  normal  0.0205939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1495  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.3 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.420653  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3563  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  29.11 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.661708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1340  fec I like protein  31.18 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2075  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.58 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2949  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.3 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2598  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.84 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1623  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  29.11 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710991  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47400  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  31.68 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00498189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.41 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3959  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  30.92 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.925362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3315  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.26 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1943  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  30.77 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.467339  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3941  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  30.77 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.664668  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3372  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  32.24 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163111  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4533  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.76 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3810  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  29.11 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.775772  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2133  RNA polymerase sigma-70 family protein  30.77 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0688  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.52 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.959596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2873  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.68 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.444727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3706  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.67 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5187  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.33 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.572123  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3264  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.99 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0951  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.941158  normal  0.954881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2728  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.25 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  33.58 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2826  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  31.61 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1828  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  0.28254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4244  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  28.22 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1203  RNA polymerase sigma-70 family protein  30 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25290  extracytoplasmic-function sigma-70 factor  30.86 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06180  RNA polymerase sigma factor  32.56 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281942  normal  0.0383866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0578  RNA polymerase sigma factor  32.08 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21550  ECF sigma factor, FecI family  28.57 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5021  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.55 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434276  normal  0.047742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0243  putative RNA polymerase sigma-70 factor FecI  34.64 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  31.76 
 
 
160 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
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NC_010501  PputW619_3532  RNA polymerase sigma factor  28.86 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.997042 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0872  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.03 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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