134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1790 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  47.47 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  47.77 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2134  regulatory protein, MarR  42.51 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2290  transcriptional regulator, MarR family  42.51 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  26.39 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  23.78 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.67 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 150 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.49 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  35 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  24.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.85 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  25.25 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.07 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  31.25 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 277 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  26.5 
 
 		 148 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 150 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 154 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>