288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1203 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  72.37 
 
 		 235 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  73.3 
 
 		 235 aa  350  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  70.43 
 
 		 229 aa  347  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  68.86 
 
 		 235 aa  336  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  66.96 
 
 		 229 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  67.12 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  64.76 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  64.41 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  64.41 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  64.41 
 
 		 242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  59.11 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  61.14 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  59.66 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  58.74 
 
 		 224 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  58.22 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  58.64 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  57.73 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  56.52 
 
 		 236 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  57.96 
 
 		 258 aa  268  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  59.46 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  57.66 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  58.18 
 
 		 237 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  60.83 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  54.22 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  55.86 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  52.73 
 
 		 233 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  51.58 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  50.9 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  52.61 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  48.87 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  48.65 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  45.33 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  45.7 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  47.3 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  46.15 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  44.09 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  43.69 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  46.88 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  43.89 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  42.6 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  40.99 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  42.79 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  41.82 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  39.53 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  37.84 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  37.39 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  39.91 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  37.1 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  41.83 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  39.2 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  41.35 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  36.94 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36.36 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  41.31 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  36.65 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  38.64 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  40.85 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.49 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  37.85 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  35.53 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  35.53 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  35.09 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  32.02 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.87 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  35.48 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  33.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.33 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  32.9 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.59 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  34.51 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  34.3 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.4 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  31.7 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  31.42 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.47 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  30.87 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  33.04 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  31.42 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  30.49 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  28.76 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  33.03 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.91 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.95 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  29.17 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.26 
 
 		 270 aa  88.6  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  26.42 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.57 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  23.92 
 
 		 347 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  41.07 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.75 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.98 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  54 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29770  nitroreductase  42.25 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  54 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  45 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  28.89 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>