More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4654 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  77.72 
 
 		 197 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 197 aa  277  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  52.2 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  53.19 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  52.88 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  47.15 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  48.86 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  37.17 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  26.29 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  50.85 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.41 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  39.73 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 307 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  29.29 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
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NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
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