268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1111 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 161 aa  320  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  71.24 
 
 		 161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 140 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.2 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 536 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  33.64 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 303 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 		 314 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 		 336 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  28.8 
 
 		 430 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.09 
 
 		 301 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.77 
 
 		 577 aa  50.8  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  34.91 
 
 		 250 aa  50.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  29.71 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  29.93 
 
 		 317 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  33.07 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  33.59 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  29.32 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 324 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  42.47 
 
 		 343 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  30.66 
 
 		 390 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 356 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  36.04 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  32.58 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  44.07 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 333 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.29 
 
 		 329 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  26.55 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 310 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  26.12 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.29 
 
 		 329 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.21 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  68.97 
 
 		 340 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 441 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>