More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7361 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_7361  membrane-fusion protein  100 
 
 		 432 aa  805    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661389  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4071  secretion protein HlyD family protein  98.84 
 
 		 432 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.54 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.32 
 
 		 480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.83 
 
 		 477 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.83 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.76 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.78 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  27.1 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.51 
 
 		 463 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.32 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.41 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1897  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.5 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.5 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.79 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.79 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.1 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.39 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.46 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  28.33 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.74 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.83 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.47 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.4 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.71 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.31 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.81 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.12 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.63 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.47 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.96 
 
 		 674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.67 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.67 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.06 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  25.59 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.41 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  28.05 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  24.38 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  26.83 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.34 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.82 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.14 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.88 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  26.7 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.48 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.48 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  23.48 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.94 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.48 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.01 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.71 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  25.94 
 
 		 475 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.56 
 
 		 472 aa  99.8  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  27.07 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.27 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.94 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.8 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.94 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.38 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.5 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.95 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.01 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.16 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.49 
 
 		 508 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.17 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.32 
 
 		 468 aa  96.3  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  24.47 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  24.47 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.48 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.17 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.75 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  27.5 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  26.03 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.17 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.98 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.8 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.04 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.7 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  21.82 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.09 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.04 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.17 
 
 		 446 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.98 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.31 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.71 
 
 		 403 aa  93.6  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.95 
 
 		 437 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.44 
 
 		 471 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.49 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.45 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  26.44 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.55 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.93 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.65 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>