222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01911 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  59.78 
 
 		 191 aa  214  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  53.26 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  45.86 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 194 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  36.87 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  28.42 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  27.23 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.42 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  28.8 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  28.16 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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