105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1657 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  100 
 
 		 279 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  71.07 
 
 		 266 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  55.75 
 
 		 269 aa  244  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  51.96 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  51.96 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  41.5 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  35.93 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  35.82 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.75 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  35.59 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  33.66 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  37 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  27.59 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.42 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.6 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.47 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  36.02 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  48.89 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  34.43 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  36.16 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.32 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.32 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  28.95 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  46.15 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  42.86 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  28.95 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  28.35 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  25.83 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  28.19 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  28.19 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  34.38 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  30.53 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  37.6 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  32.82 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  26.09 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  41.49 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  33.51 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  29.81 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  41.94 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34.81 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  32.95 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  35.96 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  35.16 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.95 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  34.07 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  40.91 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  32.09 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.38 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.56 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4651  TonB family protein  42.11 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  38.46 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  42.05 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  38.46 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.23 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.23 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  41.38 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  35.16 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  38.2 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  35.23 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.79 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  39.53 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.77 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  36.08 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  41.33 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.69 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  39.13 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  36.11 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  27.47 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.23 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  25.19 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  34.78 
 
 		 235 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  42.42 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  34.43 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.33 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  38.03 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  28.43 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  32.14 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  28.12 
 
 		 2272 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  35.23 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  27.81 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25 
 
 		 3409 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  33.33 
 
 		 174 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.13 
 
 		 2449 aa  45.8  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  28.07 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  34.21 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1397  TonB family protein  40 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  26.09 
 
 		 3471 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.09 
 
 		 3472 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  34.21 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  29.66 
 
 		 2179 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.82 
 
 		 3521 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.43 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  36.05 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  26.88 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  27.62 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.14 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  30.91 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  27.66 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  36.67 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>