More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2214 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  29.32 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.91 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  23.24 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  25.89 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  23.19 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  23.26 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  22.48 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  29.69 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>