More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0909 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 159 aa  316  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  93.08 
 
 		 159 aa  283  9e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  89.31 
 
 		 159 aa  273  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  91.72 
 
 		 159 aa  271  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  63.23 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  58.49 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  51.59 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  45.4 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  41.77 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  42.41 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  41.14 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  44.38 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  42.47 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  40.51 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  38.61 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  42.04 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  40.69 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  39.75 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  41.78 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  43.14 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  39.33 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  39.35 
 
 		 201 aa  103  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  42.04 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  38.51 
 
 		 182 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  39.87 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  39.73 
 
 		 193 aa  98.2  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  38.36 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  36.99 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  40.3 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  39.58 
 
 		 193 aa  93.6  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.41 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  39.04 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  58.7 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  28.78 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  25.87 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  38.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  26.42 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  60 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  52.27 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  48.21 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  50.88 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  50.88 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  34.48 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  48.28 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  52 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  52 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  32.04 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_002620  TC0915  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 209 aa  51.6  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 201 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 203 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  31.68 
 
 		 196 aa  50.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  40.79 
 
 		 203 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  53.33 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>