More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03488 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  55.58 
 
 		 903 aa  986    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 898 aa  1821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  77.22 
 
 		 890 aa  1318    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  46.68 
 
 		 871 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  54.87 
 
 		 900 aa  956    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.39 
 
 		 658 aa  170  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.46 
 
 		 590 aa  119  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  30.48 
 
 		 279 aa  115  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 		 428 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 368 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  30.36 
 
 		 442 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 		 477 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.46 
 
 		 417 aa  106  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 280 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  32.28 
 
 		 373 aa  104  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 256 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 261 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 281 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.9 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 229 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  33.18 
 
 		 320 aa  101  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 345 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 405 aa  100  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  35.94 
 
 		 465 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 542 aa  99  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.39 
 
 		 287 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 352 aa  99  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 308 aa  98.2  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 258 aa  98.2  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 324 aa  97.8  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 		 321 aa  98.2  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 244 aa  97.8  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 242 aa  97.4  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 281 aa  97.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 		 292 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 503 aa  97.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  34.74 
 
 		 267 aa  96.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 		 211 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.34 
 
 		 1115 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.34 
 
 		 1119 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 		 1101 aa  96.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  32.34 
 
 		 927 aa  95.9  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 		 291 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.34 
 
 		 1115 aa  96.3  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 522 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.38 
 
 		 464 aa  94.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 356 aa  94.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.84 
 
 		 1099 aa  94.7  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.84 
 
 		 1115 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 520 aa  94.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  32.84 
 
 		 273 aa  94  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 		 413 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 355 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 273 aa  94  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.18 
 
 		 1115 aa  94  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.18 
 
 		 872 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 273 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 272 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 372 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 273 aa  93.2  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.63 
 
 		 440 aa  92.4  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.77 
 
 		 273 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 322 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 273 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 240 aa  91.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 273 aa  91.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 275 aa  91.3  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 299 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  30.96 
 
 		 269 aa  90.9  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 283 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 348 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 241 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.65 
 
 		 251 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 213 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 213 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 213 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 232 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.51 
 
 		 468 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.21 
 
 		 350 aa  89.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 439 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 313 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 241 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  34.66 
 
 		 217 aa  89  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 219 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  29.32 
 
 		 373 aa  89  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2979  hypothetical protein  33.82 
 
 		 275 aa  89  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000165918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 311 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 346 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 250 aa  88.6  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  28.57 
 
 		 364 aa  88.6  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  30.15 
 
 		 312 aa  88.2  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 276 aa  88.2  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 301 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>