108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4625 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 535 aa  1021    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.19 
 
 		 523 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  39.15 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  38.35 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  38.86 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.44 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  37.27 
 
 		 536 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  37.77 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 546 aa  248  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 		 575 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  40.47 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  37.55 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.24 
 
 		 596 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  36.53 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.09 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  31.44 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.36 
 
 		 557 aa  117  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 235 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 236 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  36.21 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  28.08 
 
 		 486 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  41.1 
 
 		 582 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.41 
 
 		 500 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 549 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  33.57 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  26.86 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.64 
 
 		 562 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  30.24 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.1 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 502 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.87 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.81 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  38.84 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  29.86 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  30.71 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  30.29 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  29.32 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  29.12 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.65 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.65 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.04 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  28.79 
 
 		 618 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  24.58 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  26.97 
 
 		 481 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.82 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  32.59 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.71 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  27.56 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  25.71 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  24.95 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.54 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.57 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  29.46 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  29.81 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  34.19 
 
 		 543 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  26.05 
 
 		 486 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.17 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.91 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  24.3 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.26 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  24.39 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  25.7 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  34.58 
 
 		 665 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  44.3 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  26.44 
 
 		 454 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.8 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.8 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.69 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.51 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.58 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.58 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.58 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  38.46 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  31.06 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 563 aa  47.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 405 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28 
 
 		 619 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>