More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1100 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  100 
 
 		 383 aa  781    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  56.27 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  39.02 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  36.13 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  37.67 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  35.14 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  32.13 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  33.7 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  33.33 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  29.92 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  29.18 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  34.34 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.45 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.23 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  28.11 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  29.24 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  28.3 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.27 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.27 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  28.64 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.89 
 
 		 370 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.86 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  22.54 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.06 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.41 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.05 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.89 
 
 		 463 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  22.34 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.11 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.63 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.86 
 
 		 424 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  27.25 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.23 
 
 		 443 aa  96.3  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.78 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.13 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.58 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.93 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.33 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.16 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.08 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.67 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.14 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.8 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  25.65 
 
 		 308 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.43 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.35 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.07 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.19 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 282 aa  89.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.03 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.79 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.6 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.26 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.26 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.52 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.01 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.97 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  24.43 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  23.72 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.13 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.09 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.13 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  25.27 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.4 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.61 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  35.33 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.19 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.09 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.96 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.96 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.73 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  22.22 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.92 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.96 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.32 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.16 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.81 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  27.69 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.81 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  26.74 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.75 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.3 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  24.62 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.86 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  27.95 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>