More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1659 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  76.43 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  36.55 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.92 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.8 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.57 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  34.67 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.77 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.8 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  34.51 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.43 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.21 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.97 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.29 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  25.34 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.93 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.97 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.1 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.11 
 
 		 200 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.71 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.34 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.19 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  28.38 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  27.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  27.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.34 
 
 		 187 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.71 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  30.99 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  28.57 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.57 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.66 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.08 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  27.45 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  27.89 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  31.43 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  32.62 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.28 
 
 		 283 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  27.89 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.25 
 
 		 305 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  32.41 
 
 		 181 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.89 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  28.77 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  25.85 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.95 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.28 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.27 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  25.53 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  27.27 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  28.77 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  27.97 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  29.45 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  26.97 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  28.19 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  32.47 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  30.82 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  30.82 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  30.82 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  26.97 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.06 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  33.95 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>