More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3055 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  275  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  59.42 
 
 
138 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  46.43 
 
 
208 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  42.14 
 
 
207 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.11 
 
 
150 aa  103  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.17 
 
 
150 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.3 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.69 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.19 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.16 
 
 
156 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.39 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.96 
 
 
287 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.44 
 
 
300 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.86 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.19 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  39.6 
 
 
149 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.23 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  40.43 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.37 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.29 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.17 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.88 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.46 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.69 
 
 
280 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  34.97 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  40 
 
 
283 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  33.73 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.19 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.24 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.89 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.55 
 
 
307 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  35.51 
 
 
297 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.16 
 
 
288 aa  84  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.59 
 
 
290 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.46 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.37 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.01 
 
 
286 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.29 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.39 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  34.01 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  37.76 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  36.96 
 
 
281 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  35.33 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  35.14 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.19 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  38.97 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.11 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  35.71 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.25 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.71 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.58 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.19 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.64 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.03 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.19 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  32.14 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  35.8 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.71 
 
 
301 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.43 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  33.33 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  34.46 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.51 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  33.56 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  35.97 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  38.62 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  35.71 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.43 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.03 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.47 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.14 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  38.06 
 
 
280 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.62 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  34.48 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  35.86 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>