More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4092 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  81.95 
 
 		 206 aa  330  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  78.22 
 
 		 207 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  77.34 
 
 		 207 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  77.34 
 
 		 207 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 215 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50.78 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  45.69 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  49.13 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  49.25 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  50.9 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  47.31 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  52.76 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  45.45 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 363 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 400 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 425 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 410 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.68 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 408 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  30.07 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 391 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.49 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  38.89 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>