More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0796 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  100 
 
 		 361 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  77.09 
 
 		 361 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  32.86 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  32.57 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  32.57 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  32.57 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  31.65 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  31.65 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  30.23 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  31.77 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  31.22 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 373 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  44.05 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  41.62 
 
 		 532 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  43.45 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  41.14 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  41.04 
 
 		 532 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 554 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1871  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1737  diguanylate cyclase  39.75 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0222793  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  38.66 
 
 		 517 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2989  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01754  predicted diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1857  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  39.2 
 
 		 466 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2009  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1406  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01742  hypothetical protein  30.27 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1847  diguanylate cyclase  30.27 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.02251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2033  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  30.4 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  37.5 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 458 aa  109  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.4 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.45 
 
 		 638 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000652876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 566 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  42.14 
 
 		 508 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3308  diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 557 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2509  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  29.89 
 
 		 444 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.360795  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  37.23 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  43.98 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  40 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  34.52 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  39.75 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  32.92 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  42.46 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  40 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  39.43 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  36.87 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2409  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3348  GGDEF domain-containing protein  41.51 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  31.37 
 
 		 413 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  39.2 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  40.85 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  39.74 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.68 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.63 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  40.33 
 
 		 532 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000814  hypothetical protein  30.47 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 821 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  39.43 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.59 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  36.88 
 
 		 892 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0757  diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 489 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.371772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>