287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4098 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  100 
 
 		 319 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  61.83 
 
 		 313 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  58.13 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  55.35 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  55.31 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  52.24 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  51.94 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  52.06 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  51.58 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  50.5 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  46.93 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  46.28 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  46.67 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  45.54 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  41.67 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  35.24 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  33.23 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  33.84 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  31.29 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  33.85 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  30.15 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  34.45 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  34.15 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  34.25 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  31.45 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  36.1 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.81 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.34 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  32.91 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  32.91 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29.97 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.89 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.52 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  32.65 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.25 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  30.34 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  31.31 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  31.58 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.5 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.78 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  32.3 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  31.99 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  32.29 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.48 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.45 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.32 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  31.96 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.25 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  30.65 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  29.5 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.07 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  33.73 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.52 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  32.29 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.94 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  31.13 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.03 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.03 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  32.47 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  30.6 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  28.2 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  31.34 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>