226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1608 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 
225 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  46.84 
 
 
220 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  46.32 
 
 
220 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  46.84 
 
 
220 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  45.96 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  44.1 
 
 
199 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  46.56 
 
 
265 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  41.97 
 
 
196 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  46.56 
 
 
208 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  42.41 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 
195 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  33.68 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  34.85 
 
 
191 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
193 aa  111  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 
185 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  31.35 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  30.73 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  31.35 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  33.11 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  29.31 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  29.31 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.74 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  28.74 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  28.16 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  27.59 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  21.23 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  20.73 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.38 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  25.15 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  28.21 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.33 
 
 
449 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.74 
 
 
359 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  22.7 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  21.86 
 
 
355 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  24.35 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 
349 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.35 
 
 
320 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  26.42 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  25.34 
 
 
343 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  22.86 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  24.05 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  23.76 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  22.83 
 
 
949 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 
243 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  22.46 
 
 
232 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
224 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 
367 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 
367 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  23.08 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  19.91 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  25.87 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  22.6 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  27.59 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.27 
 
 
381 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  27.59 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  27.59 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 
360 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  24.55 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  24.66 
 
 
286 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.21 
 
 
370 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  28.67 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 
200 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 
197 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  22.42 
 
 
233 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  24.64 
 
 
261 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 
360 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  25.44 
 
 
452 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35000  uncharacterized low-complexity protein  23.49 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  26.49 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 
360 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 
356 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>