More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1122 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  100 
 
 		 371 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  100 
 
 		 375 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  100 
 
 		 375 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  48.63 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  48.63 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  48.63 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  44.41 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  33.8 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  34.65 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  34.44 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  34.93 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 370 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  32.33 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  35 
 
 		 286 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  24.44 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  29.25 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  30.82 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  26.87 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  25.82 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2527  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0159  diguanylate cyclase  28.51 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.945874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 1073 aa  73.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.49 
 
 		 1072 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.74 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  27.12 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  25.81 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  29.7 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.19 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.5 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2239  diguanylate cyclase  27.99 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.942581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2597  GGDEF  33.94 
 
 		 534 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2213  GGDEF domain-containing protein  30.6 
 
 		 641 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658691  normal  0.864608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4307  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.67 
 
 		 708 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245048  normal  0.0798721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.95 
 
 		 1093 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2227  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 662 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.115705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.67 
 
 		 814 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 285 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  29.09 
 
 		 719 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.1 
 
 		 707 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  29.09 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.44 
 
 		 1466 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02934  hypothetical protein  28.39 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  28.3 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  26.01 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0564  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.24 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  27.19 
 
 		 1076 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3611  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0267  diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 1320 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  25.62 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0336  diguanylate cyclase  30.49 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0386848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  31.41 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.25 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0538  diguanylate cyclase  25.48 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  29.94 
 
 		 753 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05442  hypothetical protein  27.98 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  25.9 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4688  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.104473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  27.43 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002974  GGDEF family protein  28.83 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.54 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.38 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06699  hypothetical protein  25.34 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.99 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  27.78 
 
 		 571 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  23.04 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 708 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  27.81 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 532 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.11 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2203  PAS:GGDEF  30.59 
 
 		 673 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  28.4 
 
 		 1057 aa  63.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.05 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3516  diguanylate cyclase  32.08 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  29.11 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  27.06 
 
 		 847 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.45 
 
 		 730 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>