More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2736 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  69 
 
 		 540 aa  757    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0184  alpha amylase, catalytic region  63.87 
 
 		 547 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 543 aa  1111    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1891  alpha amylase, catalytic region  58.76 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0261  alpha amylase  51.14 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  50.88 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  50.88 
 
 		 550 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  50 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  52.68 
 
 		 537 aa  521  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  49.8 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  54.69 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  50.19 
 
 		 550 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  49.81 
 
 		 544 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  51.57 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  50.97 
 
 		 550 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  50.19 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0601  alpha-glucosidase  47.48 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.642438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3128  alpha amylase, catalytic region  52.02 
 
 		 542 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209805  normal  0.0115348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4341  alpha amylase catalytic region  48.69 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  52.85 
 
 		 560 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1788  alpha amylase, catalytic region  49.2 
 
 		 544 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  48.39 
 
 		 586 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  49.44 
 
 		 548 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2028  alpha amylase, catalytic region  48.61 
 
 		 557 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  48.98 
 
 		 556 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2039  alpha amylase catalytic region  49.9 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  47.49 
 
 		 541 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2299  alpha amylase catalytic region  49.69 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.823743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  50.19 
 
 		 548 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  48.61 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  48.3 
 
 		 540 aa  495  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  48.69 
 
 		 552 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4573  hypothetical protein  49.49 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2287  alpha amylase catalytic region  49.49 
 
 		 540 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2086  alpha amylase catalytic region  49.69 
 
 		 540 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  48.54 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2133  alpha amylase, catalytic region  48.2 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  48.2 
 
 		 540 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0295  alpha amylase catalytic region  49.61 
 
 		 551 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3326  alpha amylase catalytic region  47.73 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1949  alpha amylase protein  50.1 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  49.9 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  50.19 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1370  alpha amylase domain-containing protein  49.03 
 
 		 536 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0039  alpha amylase, catalytic region  49.03 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2954  alpha amylase catalytic region  46.2 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  43.35 
 
 		 549 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  45.18 
 
 		 529 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  45.35 
 
 		 525 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  43.49 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  40.77 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  43.22 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  43.11 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  40.74 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  45.13 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  41.58 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  41.2 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  44.38 
 
 		 541 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0226  alpha amylase catalytic region  42.8 
 
 		 537 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.547651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  42.11 
 
 		 538 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  40.69 
 
 		 545 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  40.9 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  38.62 
 
 		 543 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  38.45 
 
 		 564 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  42.13 
 
 		 528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  43.41 
 
 		 530 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2302  alpha amylase catalytic region  42.03 
 
 		 518 aa  359  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  40.49 
 
 		 524 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  41.35 
 
 		 538 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  44.64 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1988  alpha amylase catalytic region  41.28 
 
 		 546 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  41.11 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  42.66 
 
 		 542 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  40.2 
 
 		 536 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  38.34 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  43.53 
 
 		 533 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  42.22 
 
 		 507 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  39.52 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  34.92 
 
 		 551 aa  336  5.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  42.69 
 
 		 538 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  45.35 
 
 		 544 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  40.62 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  36.72 
 
 		 577 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  35.83 
 
 		 563 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  37.87 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  40.7 
 
 		 543 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  35.89 
 
 		 554 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.03 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  35.77 
 
 		 554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  41.26 
 
 		 522 aa  329  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.21 
 
 		 560 aa  329  6e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  35.31 
 
 		 549 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  35.31 
 
 		 549 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  37.31 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  40.31 
 
 		 735 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  36.69 
 
 		 556 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  33.63 
 
 		 559 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  38.2 
 
 		 547 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.8 
 
 		 560 aa  327  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>