299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2720 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  66.19 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  49.47 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  49.64 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 284 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  46.79 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  48.07 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  43.77 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  45.55 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  46.81 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  44.72 
 
 		 283 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  46.81 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  37.94 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  46.79 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  40.43 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  39.01 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  41.2 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  40.35 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  37.5 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  37.23 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  37.23 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  37.23 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  34.98 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  32.28 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  37.59 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.12 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  28.98 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  28.98 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.78 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.24 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  18.44 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.11 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  30.17 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.69 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.5 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.6 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.53 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.65 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.6 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  23.36 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  22.52 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  27.36 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.33 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  35.09 
 
 		 126 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.33 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  27.27 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.21 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.66 
 
 		 155 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.94 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.93 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  27.67 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.41 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  24.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  27.38 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  26.24 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  26.34 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  28.89 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 141 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24.01 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  28.35 
 
 		 136 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.73 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.44 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.5 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  25.13 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  29.88 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  27.52 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.84 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 147 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.71 
 
 		 151 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.06 
 
 		 136 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  26.35 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  23.81 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 130 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.82 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 147 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 128 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  26.19 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  30.26 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  27.35 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  21.38 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>