More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1497 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 689 aa  1382    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 751 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.06 
 
 		 980 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.46 
 
 		 931 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 749 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  32.55 
 
 		 936 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 779 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 751 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 1002 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 760 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 760 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 769 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 758 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 751 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  33.14 
 
 		 776 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1002 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1002 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 769 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 765 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 756 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  30.19 
 
 		 762 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 746 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 762 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 775 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1013 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.6 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.72 
 
 		 852 aa  221  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.01 
 
 		 772 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 758 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  34.52 
 
 		 812 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 771 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 721 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.06 
 
 		 844 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 775 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 762 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  36.09 
 
 		 798 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.81 
 
 		 849 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  36.62 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 855 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 752 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  31.34 
 
 		 755 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 743 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 748 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 		 732 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  31.64 
 
 		 723 aa  208  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 748 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.81 
 
 		 846 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  32.21 
 
 		 728 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 746 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  31.46 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  31.19 
 
 		 772 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 757 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.2 
 
 		 745 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.02 
 
 		 847 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  34.05 
 
 		 856 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 791 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  32.74 
 
 		 755 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.09 
 
 		 842 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 709 aa  201  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 745 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  33.57 
 
 		 567 aa  200  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 		 731 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  32.2 
 
 		 728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.07 
 
 		 844 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  26.38 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 		 847 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  30.12 
 
 		 847 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  31.12 
 
 		 759 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  32.9 
 
 		 760 aa  194  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  27.95 
 
 		 508 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 799 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  31.66 
 
 		 745 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  31.23 
 
 		 993 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 722 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 		 770 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  30.58 
 
 		 1003 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  28.21 
 
 		 506 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  30.51 
 
 		 625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 864 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  30.21 
 
 		 856 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.71 
 
 		 884 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 740 aa  173  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 774 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  55.97 
 
 		 424 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 865 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  29.3 
 
 		 822 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  51.69 
 
 		 366 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 783 aa  165  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  47.31 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 871 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.01 
 
 		 438 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1844  diguanylate cyclase  42.36 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674113  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  48.81 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  49.42 
 
 		 753 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0221  GGDEF domain-containing protein  28.32 
 
 		 710 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  50 
 
 		 227 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>