More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1409 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1409  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 385 aa  755    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.13685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.69 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  56.18 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.64 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  41.16 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  43.23 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.39 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.95 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  38.22 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.76 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.72 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.02 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.86 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  36.86 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  37.46 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  38.41 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  35.88 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  36.45 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.42 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  36.24 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  32.77 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.52 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.9 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.8 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  32.47 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 416 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.62 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  38.59 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  37.18 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  36.14 
 
 		 382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  36.93 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  37.94 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  34.07 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  32.8 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  33.95 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.81 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  32.58 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 447 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  37.86 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 		 469 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  35.45 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  34.46 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  36.09 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  36.68 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  31.96 
 
 		 418 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.74 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.86 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.73 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  34.1 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  34.77 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  34.1 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  31.5 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  31.3 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  34.82 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  35.71 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  34.85 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  37.78 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  32.94 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3015  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  33.93 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.23 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  33.16 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.93 
 
 		 416 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  36.93 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.67 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.22 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>