106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2639 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  32.43 
 
 		 356 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  31.43 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 398 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  32.77 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  32.95 
 
 		 372 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  28.49 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  29.44 
 
 		 364 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 356 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  28.99 
 
 		 366 aa  98.6  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  27.47 
 
 		 354 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  30.46 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  30 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  32.65 
 
 		 315 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 370 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.11 
 
 		 354 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  28.42 
 
 		 301 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  27.98 
 
 		 363 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.91 
 
 		 319 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  30 
 
 		 325 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  30.59 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  25.42 
 
 		 319 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.16 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.16 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  25.45 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  24.83 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  26.62 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0678  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  21.74 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1311  cobalamin B12-binding  26.14 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 319 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.78 
 
 		 780 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  24 
 
 		 297 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  23.86 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  28.68 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  28.46 
 
 		 337 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1728  cobalamin B12-binding domain protein  22.84 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  25.64 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  25.56 
 
 		 781 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  28.03 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 316 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  23.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  20.93 
 
 		 768 aa  48.9  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  26.72 
 
 		 316 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 322 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  23.08 
 
 		 315 aa  48.5  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  20.93 
 
 		 768 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  23.39 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  21.97 
 
 		 1136 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1133 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1133 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  22.3 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.02 
 
 		 1132 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  21.64 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  18.31 
 
 		 793 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  25.64 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 293 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  22.36 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1235 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  22.37 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1235 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  25.18 
 
 		 295 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  18.5 
 
 		 804 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  25.42 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  23.08 
 
 		 832 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  23.73 
 
 		 1266 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 		 389 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1236 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1235 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1235 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  23.65 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1278 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.74 
 
 		 791 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  25.6 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1236 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0776  cobalamin B12-binding domain protein  21.02 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  23.13 
 
 		 1136 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  20 
 
 		 1239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  22.88 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1234 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  20 
 
 		 1234 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>