More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0440 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
686 aa  1407    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.7 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 
849 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
896 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  24.54 
 
 
603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  31.44 
 
 
474 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
1193 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  28.91 
 
 
449 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 
1509 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 
565 aa  104  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 
888 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 
1044 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
589 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.4 
 
 
1297 aa  94  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.14 
 
 
351 aa  94  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  23.63 
 
 
1113 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
634 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
984 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1938  PAS/PAC domain-containing protein  25.85 
 
 
632 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  20.31 
 
 
3706 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
556 aa  91.3  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  50.57 
 
 
598 aa  90.9  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  25.64 
 
 
471 aa  90.9  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 
630 aa  90.5  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 
378 aa  90.5  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
802 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 
968 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  32.41 
 
 
681 aa  88.2  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
906 aa  87.4  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  20.77 
 
 
872 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  48.28 
 
 
753 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  20.6 
 
 
897 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
805 aa  84.3  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 
1714 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
1758 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
1078 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  41.24 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  51.47 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  24.3 
 
 
1210 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
348 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.927247  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  24.53 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  47.56 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
1001 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 
2693 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.01 
 
 
1260 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  23.14 
 
 
624 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
646 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 
681 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.71 
 
 
1260 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2947  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 
598 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.56 
 
 
582 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.85 
 
 
1413 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
1276 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.83 
 
 
518 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.79 
 
 
1478 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 
930 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 
761 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.48 
 
 
1021 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.91 
 
 
900 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1399 aa  74.3  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.85 
 
 
1465 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
645 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  42.7 
 
 
336 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 
745 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
1055 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  29.93 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 
1255 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  22.64 
 
 
914 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.24 
 
 
781 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  23.93 
 
 
1182 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  41.3 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.7 
 
 
1331 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.37 
 
 
1423 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 
1501 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1193 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1193 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  24.48 
 
 
1236 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  24 
 
 
1016 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 
1230 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2453  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
603 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704197  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 
1131 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 
844 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 
1391 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  23.6 
 
 
1041 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.06 
 
 
919 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
930 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  23.79 
 
 
1317 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
968 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
635 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 
1202 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.34 
 
 
1791 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  24.59 
 
 
1200 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.33 
 
 
1207 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.91 
 
 
1362 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 
1309 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  22.22 
 
 
1065 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25.14 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>