More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0421 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 357 aa  713    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 		 906 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  55.43 
 
 		 630 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  58.43 
 
 		 888 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.8 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  52.22 
 
 		 753 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  51.16 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 449 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 1177 aa  93.2  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.62 
 
 		 686 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  55.68 
 
 		 582 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.25 
 
 		 518 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 805 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  46.51 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 1226 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 1071 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 871 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1229 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1301 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 955 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 		 603 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  47.83 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 1101 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1121 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  43.68 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  27.38 
 
 		 1023 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  30.66 
 
 		 883 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 980 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 896 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  45.68 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  43.18 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1225 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  26.83 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  27.5 
 
 		 1258 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.69 
 
 		 1258 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  40.22 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1069 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  29.03 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 1039 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 1276 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  29.03 
 
 		 801 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  29.03 
 
 		 801 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  27.43 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  29.03 
 
 		 801 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1434  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1262 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 767 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 1648 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.94 
 
 		 1000 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.62 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  22.48 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1053 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2596  putative PAS/PAC sensor protein  25.7 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 1245 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 1758 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  26.95 
 
 		 1092 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1055 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 633 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 981 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  29.66 
 
 		 1116 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1395  sensory box sensor histidine kinase  25.1 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 997 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 801 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0315  sensory box sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 785 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.54 
 
 		 804 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1003 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 1399 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 1054 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 1354 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.05 
 
 		 1134 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.17 
 
 		 1248 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 756 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  26.83 
 
 		 1379 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 613 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 604 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.04 
 
 		 745 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 976 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 984 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 2072 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>