More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0134 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 694 aa  1420    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  48.28 
 
 		 727 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  47.03 
 
 		 687 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  46.74 
 
 		 687 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  46.7 
 
 		 719 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  46.11 
 
 		 681 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  44.72 
 
 		 692 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  46.17 
 
 		 682 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  46.17 
 
 		 680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  44.62 
 
 		 677 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  45.78 
 
 		 694 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  45.87 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  46.04 
 
 		 685 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  45.57 
 
 		 724 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  45.47 
 
 		 742 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  45.47 
 
 		 677 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 681 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 681 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  46.18 
 
 		 751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  46.32 
 
 		 685 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  45.35 
 
 		 713 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  43.84 
 
 		 702 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 727 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 689 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 681 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  36.23 
 
 		 681 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.68 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 702 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 706 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  34.44 
 
 		 758 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 689 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  34.29 
 
 		 758 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  34.29 
 
 		 758 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 758 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 709 aa  359  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 682 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 835 aa  349  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 705 aa  347  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  33.48 
 
 		 758 aa  346  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 730 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 744 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 821 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 685 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 797 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 693 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 695 aa  325  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 751 aa  324  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  32.73 
 
 		 709 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 702 aa  308  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 705 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  29.23 
 
 		 778 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  30.04 
 
 		 801 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 708 aa  302  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 709 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 719 aa  291  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 714 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 719 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 714 aa  286  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  30.2 
 
 		 744 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 707 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  31.92 
 
 		 774 aa  267  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 784 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 733 aa  263  6.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 695 aa  261  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 723 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 731 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 784 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  30.33 
 
 		 782 aa  258  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 789 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 783 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 799 aa  249  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 759 aa  195  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 836 aa  150  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 797 aa  125  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 735 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  23.95 
 
 		 868 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  23.2 
 
 		 776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 776 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 732 aa  103  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 818 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 741 aa  85.1  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  21.66 
 
 		 724 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 776 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 678 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.51 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.69 
 
 		 693 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 652 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>