114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3553 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 159 aa  329  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  40.43 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  37.89 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  37.89 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.22 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  36.78 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.97 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  29.58 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  29.46 
 
 		 402 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.37 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  32.94 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  34.18 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 118 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  28.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  28.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  28.47 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  35.53 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  32.52 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  33.78 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  33.73 
 
 		 480 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  27.93 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  26.13 
 
 		 392 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  33.75 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.91 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 122 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  31.18 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>